丙酮酸乙酯是杀菌剂噻菌灵的中间体，用于有机合成。同时是一种重要的医药和化工中间体,广泛应用于医药、农药、香精香料、食品添加剂、空气清新剂、精细化学品等行业。可用于合成心血管扩张剂等药物；也可用于美白和营养皮肤的化妆品，能够促进皮肤伤口愈合，预防和治疗以开裂、剥落和鳞化为特征的皮肤疾病；可用作空气清新剂中的高效活性成分，可以有效清除空气中的氨及甲硫醇；本身具有特殊的香味，因而可以应用于香精、香料中；也是合成树脂和塑料的重要原料。