近日,泛生子在2021年美国癌症研究协会年会(AACR2021)发布了22项全新研究成果。企业运用RNA融合检测、新型MSI检测生信算法模型、“一步法”等创新技术,及Onco PanscanTM、肉瘤全体系基因检测等核心产品,携手13家国内顶级医院,围绕中国人群深入分析肺癌、肠癌、胰 腺癌、神经系统肿瘤、胸腺癌等多癌种遗传、突变、融合特征分布,验证并挖掘多癌种免疫治疗标志物有效性,以及罕见案例和新型疗法,进而为癌症精准诊疗方式、诊疗产品设计等提供重要启示(附研究列表)。
泛生子首席医疗官胡云富博士表示:“作为基础研究与临床应用的桥梁,泛生子始终致力于为二者建立良性互促关系,全力推动转化医学发展。本次研究成果,基于企业创新技术及产品,助力多癌种基因组学的特征分析及技术优化路线探索,并为新产品设计提供思路。如在软组织肉瘤领域,通过RNA融合检测技术,大幅提高融合检出率,为更多肉瘤患者提供获益可能;在遗传性肿瘤领域,Li-Fraumeni综合征筛查方法的提出也将提升该类患者检出率,为其提供更多干预机会;在结直肠癌领域,KMT2C/2D失活突变的分析也将为免疫治疗适用患者提供更多获益可能。此外,罕见病例挖掘及其新型疗法的尝试,将推动该类型患者的诊疗研究进一步发展。”
探索技术优化路线
为打破DNA-seq针对检测基因融合所存在的局限性,研究2288对常规技术进行优化,在RNA层面实现了更精准、高效、低耗的融合基因突变检测,在142人的软组织肉瘤队列中进行评估及验证。研究显示相比DNA单独检测,DNA+RNA综合检测对于软组织肉瘤融合的检出率提高了177%,可为更多肉瘤患者提供临床获益可能。
研究2080对NGS MSI生信算法进行了多重优化,并与金标准PCR对比,在2523例泛癌种大样本中进行验证。结果表明,优化后的算法与金标准PCR检测方法一致性达99.9%。其中MSI-H阳性预测率PPV为98.73%,MSS阴性预测率NPV为99.92%。
关注遗传性肿瘤特征
两项研究(#1464、#2557)通过对胚系突变的深入分析,为Li-Fraumeni综合征提供了筛查方法,探讨了中国人群胰 腺癌患者遗传特征及具体分布,为遗传性肿瘤筛查及诊疗提供证据及思路。
探索基因突变及融合特征
九项研究(#2217、#2163、#2223、#2216、#2215、#2313、#2252、#2183、#2182)分别对软组织肉瘤、黑色素瘤、神经内分泌肿瘤、非小细胞肺癌、胸腺癌、小肠腺癌、壶腹癌等多个癌种进行突变、融合特征多维度探索,寻找潜在精准治疗靶点、耐药靶点及有效应对措施。
挖掘免疫治疗标志物
四项研究(#1639、#1640、#1641、#1681)分别探讨了KMT2C/D失活突变、DDR信号通路相关基因变异、ARID1A突变以及BRCA1/2突变对泛癌种免疫治疗疗效的预测作用,为免疫治疗提供启示。
关注罕见案例及新型疗法
五项研究(#0803、#0422、#1209、#1199、#0625)分别在林奇综合征相关肺癌、转移性黑色素瘤、间变性甲状腺癌、甲状腺乳头状癌以及脂肪肉瘤患者中检测出特殊的分子异常。研究通过分子检测辅助患者进行诊断分型,为患者采用新型的靶向治疗、免疫治疗方案,最终使患者成功获益。
编号 | 题目 |
1464 | Enrichment and screening of LFS patients by analyzing TP53 germline mutations of |
2252 | Genome profiling of thymic carcinoma identifies putative driver mutations in the NF- |
2557 | Germline mutation landscape in a large cohort of Chines pancreatic cancer patients |
0803 | Molecular diagnosis and immunotherapy of a rare lung carcinoma patient associated |
0422 | Sequential targeted therapy and immunotherapy of a BRAF positive metastatic |
2183 | Genomic profiling of small bowel adenocarcinoma reveals targetable mutations in |
2217 | More somatic mutations can be detected in cerebrospinal fluid ctDNA of NSCLC |
2182 | Evaluation of somatic and germline mutations in ampullary carcinoma reveals |
1209 | An effective treatment for recurrent and inoperable anaplastic thyroid carcinoma |
1681 | Correlation of BRCA1/2 mutations with response to immune checkpoint inhibitors in |
1641 | The predictive values of ARID1A mutations for response to immune checkpoint |
1639 | Correlation of KMT2C/D loss-of-function mutations with PD-L1 expression and |
1640 | Correlations of DNA damage response gene alterations with response to immune |
2288 | Identification of gene fusions in soft tissue sarcoma improved by integrative DNA |
2163 | Molecular characteristics of CDK4 and/or MDM2 amplification in Chinese soft tissue |
0625 | Co-amplification of CDK4 and MDM2 plus HMGA2 fusion in a patient with myogenic |
2223 | Distinct genomic features of cutaneous, acral and mucosal melanomas in a Chinese |
2216 | Exploration of the genomic features of pan-neuroendocrine tumors in a Chinese |
2215 | Landscape of RET fusion identified by next–generation sequencing in a Chinese |
1199 | Mosaic KRAS G12S mutation associates with poor outcome in papillary thyroid |
2080 | Tumor microsatellite instability detection method using paired tumor-normal |
2313 | The characteristics of ERBB2 exon 20 insertion in a large cohort of Chinese NSCLC |
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